Вернуть можно.
Учётный документ составить (поступления на склад из производства) и провести его.
Остатки, обороты - всё правильно будет показываться. А вот в режимах Фактические затраты и Затраты план-факт в текущей версии не предусмотрено, чтобы такие операции тоже отображались.
Технически сделать можно. С режимом Фактические затраты ещё более-менее понятно. И то в случае, если смотреть фактические затраты вообще, за период. А если смотреть только по конкретному заказу (заказам), то вопрос тот же, что и для План-факт.
А вот с режимом Затраты план-факт много пока вопросов. Например:
"Остаток" образовался с материалов выданных не под один какой-то конкретный заказ, а постепенно накопился с 15-ти заказов . Потом этот остаток весь разом вернули на склад. Дальше вы выбираете из этих 15-ти заказов 7 и нажимаете Затраты план-факт. Как при этом учитывать такой возврат? Что показывать?